ChIL-sequencing kan worden gebruikt om de ChIL-sequencing genvolgorde te onderzoeken of om de kopieerfactor en een andere chromatine-geassocieerde eiwitbinding te analyseren. Eiwit-DNA-interacties reguleren de genvorm van expressie en zijn verantwoordelijk voor veel biologische processen en aandoeningen. Deze epigenetische informatie is complementair aan genotype en vorm van expressieonderzoek. ChIL-Seq is een alternatief voor de huidige norm van ChIP-seq. ChIP-Seq lijdt aan beperkingen vanwege de verknopingsstap in ChIP-Seq-protocollen die epitoopmaskering kunnen bevorderen en vals-positieve bindingsplaatsen kunnen genereren. Bovendien lijdt ChIP-seq aan suboptimale signaal-ruisverhoudingen en een slechte resolutie. ChIL-sequencing heeft het voordeel dat het een eenvoudigere techniek is die geschikt is voor een lage sample-input vanwege de hoge signaal-ruisverhouding, waardoor er minder diepte nodig is bij het sequencen voor een hogere gevoeligheid.
Afbeelding 125A | Figuur 7. Voorgesteld DNA lusmechanisme tussen distale regulerende eiwitten en de promotorregio | Arolland / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:ChIPPET9.JPG) van Wikimedia Commons
Auteur : Milos Pawlowski
Reacties
Een reactie posten