Tweekanaals versus eenkanaals detectie

Tweekleurig microarrays of tweekanaals microarrays worden gewoonlijk gehybridiseerd met cDNA dat is bereid uit twee te vergelijken monsters (bijv. Ziek weefsel versus gezond weefsel) en die zijn gelabeld met twee ongelijke fluoroforen. Fluorescerende kleurstoffen die doorgaans worden gebruikt voor cDNA-labeling zijn Cy3, dat een fluorescentie-emissiegolflengte heeft van 570 nm (overeenkomend met het groene deel van het lichtspectrum), en Cy5 met een fluorescentie-emissiegolflengte van 670 nm (overeenkomend met het rode deel van het licht). spectrum). De twee Cy-gelabelde cDNA-monsters worden gemengd en gehybridiseerd tot een enkele microarray die vervolgens wordt gescand in een microarray scanner om fluorescentie van de twee fluoroforen te visualiseren na excitatie met een laserstraal van een gedefinieerde golflengte. Relatieve intensiteiten van elke fluorofoor kunnen vervolgens worden gebruikt in op ratio gebaseerd onderzoek om up-gereguleerde en down-gereguleerde genen te onthullen.

Afbeelding 146A | Twee Affymetrix-chips. Een match wordt linksonder getoond om de maat te vergelijken. | Geen machineleesbare auteur opgegeven. Veronderstelde Schutz (op basis van auteursrechtclaims). / CC BY-SA (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Affymetrix-microarray.jpg) van Wikimedia Commons

Afbeelding 146A | Twee Affymetrix-chips. Een match wordt linksonder getoond om de maat te vergelijken. | Geen machineleesbare auteur opgegeven. Veronderstelde Schutz (op basis van auteursrechtclaims). / CC BY-SA (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Affymetrix-microarray.jpg) van Wikimedia Commons

Auteur : Milos Pawlowski

Referenties:

Moleculaire biologietechnieken I

Technieken van moleculaire biologie II

Reacties