Dynamische genomen met een hoge plasticiteit zijn nodig om pathogenen, meestal bacteriën, te laten overleven in veranderende omgevingen. Met behulp van high-throughput sequencing-methoden en in silico-technologieën is het mogelijk om veel van deze dynamische genomische gebeurtenissen te onthullen, te vergelijken en te catalogiseren. Genomische diversiteit is belangrijk bij het detecteren en behandelen van een pathogeen, aangezien deze gebeurtenissen de service en samenstelling van het pathogeen kunnen veranderen. Er is behoefte aan analyse van meer dan een enkele genoomaaneenschakeling van een pathogene soort om pathogene mechanismen te begrijpen. Vergelijkende genomica is een methodologie waarmee wetenschappers de genomen van verschillende soorten en stammen kunnen vergelijken. Er zijn verschillende voorbeelden van succesvolle vergelijkende genomics-onderzoeken, waaronder het onderzoek van Listeria en Escherichia coli. Sommige onderzoeken hebben geprobeerd het verschil tussen pathogene en niet-pathogene microben aan te pakken. Dit onderzoek blijkt echter moeilijk te zijn, aangezien een enkele bacteriesoort veel stammen kan hebben en de genomische inhoud van elk van deze stammen varieert.
Afbeelding 383A | Een microarray -chip bevat complementair DNA (cDNA) voor veel interessante sequenties. Het cDNA fluoresceert wanneer het hybridiseert met een bijpassend DNA -fragment in het monster. | Nationaal kankerinstituut / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Microarray_Comparative_Genomic_Hybridization.jpg) van Wikimedia Commons
Auteur : Merim Kumars
Referenties:
Medische microbiologie II: sterilisatie, laboratoriumdiagnose en immuunrespons
Reacties
Een reactie posten