Ion Torrent halfgeleider-sequencing

Ion Torrent Systems Inc. (nu eigendom van Life Technologies) heeft een systeem ontwikkeld dat gebaseerd is op het gebruik van standaard sequencing-chemie, maar met een nieuw op halfgeleiders gebaseerd detectiesysteem. Deze bewerking van sequencing is gebaseerd op de detectie van waterstofionen die vrijkomen tijdens de polymerisatie van DNA, in tegenstelling tot de optische methoden die worden gebruikt in andere sequentiesystemen. Een microwell met een sjabloon DNA te sequencen streng wordt overspoeld met een enkel type nucleotide. Als het geïntroduceerde nucleotide complementair is aan het leidende templaat-nucleotide, wordt het opgenomen in de groeiende complementaire streng. Hierdoor komt er een waterstofion vrij dat een overgevoelige ionsensor activeert, wat aangeeft dat er een reactie heeft plaatsgevonden. Als homopolymeerherhalingen aanwezig zijn in de aaneenschakeling van de matrijs, zullen meerdere nucleotiden in een enkele cyclus worden opgenomen. Dit leidt tot een overeenkomstig aantal vrijgekomen waterstofatomen en een proportioneel hoger elektronisch signaal.

Afbeelding 152A | Bibliotheekvoorbereiding voor het SOLiD-platform | Philippe Hupé / CC BY-SA (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Library_preparation_for_the_SOLiD_platform.svg) van Wikimedia Commons

Afbeelding 152A | Bibliotheekvoorbereiding voor het SOLiD-platform | Philippe Hupé / CC BY-SA (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Library_preparation_for_the_SOLiD_platform.svg) van Wikimedia Commons

Auteur : Milos Pawlowski

Referenties:

Moleculaire biologietechnieken I

Technieken van moleculaire biologie II

Reacties